Лаборатория является важнейшей составной частью археологической экспедиции. Именно в ней производится обработка, реставрация находок, проводятся теоретические и практические занятия, готовится научный отчет, находятся библиотека, архив и фонды. Сейчас Учебно-исследовательская лаборатория экспедиции состоит из следующих помещений в Северном корпусе университета (пл. Свободы, 6): 1) помещение для библиотеки и архива (комн. 490); 2) помещение для обработки и реставрации находок, занятий со студентами и проведения научных семинаров (комн. 119); 3) помещение фондохранилища и склада полевого имущества (комн. 029).
Пионером создания профильной археологической лаборатории в стенах высших учебных заведений Харькова является канд. ист. наук, доцент Национального педагогического университета имени Г.С. Сковороды В.В. Колода. Под его руководством там в 1993 г. возникла камеральная, а с 1998 г. – научно-исследовательская лаборатория. Нами был позаимствован также опыт создания и работы Учебной научно-исследовательской лаборатории археологических исследований Института исторического образования Киевского национального педагогического университета имени М.П. Драгоманова, возникшей под руководством Н.М. Кравченко еще в прошлом столетии, но оформленной 28 сентября 2005 г. С началом широких раскопок археологического комплекса Войтенки ощущалась острая необходимость в помещении для обработки находок и написания отчета. Зимой 2004 – весной 2005 гг. директор Областной станции юных туристов канд. пед. наук В.А. Редина любезно предоставила для этой цели комнату кружка юных археологов, которым руководили тогда М.В. Любичев и К.В. Мызгин.
Созданию лаборатории способствовала передача в 2004 г. университету здания на площади Свободы, 6 (в 1946-1992 гг. там находилась Военная инженерная радиотехническая академия ПВО имени Л.А.Говорова, затем – Военный университет), которое стало называться «Северным корпусом» университета. Летом 2005 г., перед началом второго полевого сезона в Войтенках, экспедиции была временно предоставлена маленькая комната на первом этаже здания, где хранилось закупленное экспедицией за свои средства полевое имущество и снаряжение. В декабре 2005 г. ректор подписал приказ о передаче под лабораторию экспедиции комнаты № 490. Мы вошли в нее 3 января 2006 г. и начали ремонт, используя скудные средства, пожертвованные друзьями экспедиции и самими ее членами.
23 февраля 2006 г. состоялось торжественное открытие помещения лаборатории (комната № 490 Северного корпуса). Алую ленточку на входе перерезал декан исторического факультета, профессор С.И. Посохов. В этой комнате разместились чертежные столы, компьютер, ксерокс, шкафы с книгами и архив. Но для нормального функционирования экспедиции одной комнаты было недостаточно. Полевое имущество экспедиции по-прежнему хранилось во временном, не приспособленном для этого помещении. В январе 2007 г. начались ремонтные работы в комнате № 119 цокольного этажа, а 19 июня 2007 г. она была торжественно открыта как камеральное помещение для хранения и обработки находок, проведения занятий с лаборантами. К этому времени научно-исследовательская лаборатория экспедиции фактически была создана и как научная проблемная группа и как помещение с необходимым оборудованием для работы этой группы. Ученый совет университета своим решением от 29 ноября 2007 г. (протокол № 10) утвердил создание на историческом факультете Научно-исследовательской лаборатории Германо-Славянской археологической экспедиции и «Положение» о ней. На основании этого решения 5 июня 2008 г. ректор университета В.С. Бакиров издал приказ «О создании научно-исследовательской лаборатории Германо-Славянской археологической экспедиции» (приказ № 1801-1/103).
Благодаря поддержке декана факультета С.И. Посохова лаборатория финансировалась из внебюджетных средств (0, 1 ставка зав. лабораторий, две по 0,5 ставки старшего лаборанта). На заседании Ученого совета исторического факультета 18 декабря 2009 г. был одобрен отчет о работе лаборатории и экспедиции.
25 декабря 2012 г. состоялось торжественное открытие комнаты № 490 лаборатории после ремонта. Теперь в «Верхнем помещении» находятся книжные шкафы-купе с библиотекой, компьютеры. На стенах расположены постеры о совместных научных проектах экспедиции, докладах на международных конференциях, выставках, стенд о направлениях работы экспедиции, большая топографическая карта Украины и прилегающих территорий. Одновременно модернизация была проведена в «нижнем помещении» (комната № 119): там были установлены новые стеллажи для находок. Весной 2013 г. была проделана огромная работа по переводу лаборатории на бюджетное финансирование, приданию ей, помимо исследовательских, также и учебных функций. Огромную помощь и поддержку в этом оказали декан факультета С.И. Посохов и начальник Планово-финансового отдела университета Н.С. Хруслова.
20 мая 2013 г. ректор университета академик В.С. Бакиров, на основании решения Ученого совета исторического факультета от 19 апреля 2013 г. и решения Совета университета от 26 апреля 2013 г. подписал приказ № 1801-1/140 «О создании учебно-исследовательской лаборатории Германо-Славянской археологической экспедиции в структуре исторического факультета и утверждении положения». Теперь в лаборатории имеется пять бюджетных ставок, более четко распределены обязанности между ее сотрудниками. В июне были начаты ремонтные работы в еще одном помещении для лаборатории – комнате № 029. В сентябре 2013 г. оно вошло в состав лаборатории в качестве фондохранилища и склада имущества.
На общем собрании коллектива Учебно-исследовательской лаборатории Германо-Славянской археологической экспедиции были сформулированы основные направления ее деятельности, выработан план работы, которые были утверждены деканом факультета 10 октября 2013 г.
При лаборатории действует фундаментальная специализированная библиотека, включающая в себя монографии, сборники статей и периодические издания, прежде всего, касающиеся римского времени и эпохи Великого переселения народов. Старшим лаборантом М.Ю. Филатовой формируется электронный каталог библиотеки, имеющий автоматизированную систему поиска. Формируется также и электронная библиотека, вмещающая тысячи публикаций в электронном виде, касающиеся истории и археологии I тысячелетия нашей эры.
Помимо ставших традиционными Лаборантских занятий, в осеннем семестре 2013/2014 учебного года, под руководством доцента К.В. Мызгина был начат археологический практикум со студентами, специализирующимися по археологии.
